Balai Besar Penerapan Modernisasi Pertanian Jawa Timur didukung oleh sumber daya manusia (SDM) untuk mendukung tugas dan fungsi. SDM tersebut berdasarkan fungsionalnya terdiri dari fungsional khusus, fungsional umum atau pelaksana, dan jabatan struktural.

| No | Nama | Jabatan | Satuan Kerja |
|---|---|---|---|
| 41 | Dr. Ir. PRIATNA SASMITA, M.Si. | ||
| 42 | Dr. Ir. SYAMSUDDIN, M.Sc | ||
| 43 | Dr. Ir. TITIK SUNDARI, MP | ||
| 44 | Dr. ISMATUL HIDAYAH, SP.,MP | KEPALA BALAI BESAR PENERAPAN MODERNISASI PERTANIAN JAWA TIMUR | |
| 45 | Dr. NOOR ROUFIQ AHMADI, S.TP.,MP | KEPALA BALAI PERAKITAN DAN PENGUJIAN TANAMAN SAYURAN | Balai Perakitan dan Pengujian Tanaman Sayuran |
| 46 | Dr. NUR'AINI HERAWATI, S.Si. M.Sc. S.Si. M.Sc. | KEPALA BALAI PERAKITAN DAN PENGUJIAN TANAMAN ANEKA KACANG | Balai Perakitan dan Pengujian Tanaman Aneka Kacang |
| 47 | Dr. SRI SUHESTI, SP.,MP | KEPALA BALAI PERAKITAN DAN PENGUJIAN TANAMAN PEMANIS DAN SERAT | Balai Perakitan dan Pengujian Tanaman Pemanis dan Serat |
| 48 | Dr. STEIVIE KAROUW, STP, M.Sc | ||
| 49 | Dr. TEDY DIRHAMSYAH, SP, MAB | ||
| 50 | Dr. Zainal Abidin SP., MP | KEPALA BALAI BESAR PERAKITAN DAN MODERNISASI PASCAPANEN PERTANIAN | Balai Besar Perakitan dan Modernisasi Pascapanen Pertanian |